手术是治疗卵巢囊肿的唯一办法，但绝大多数患者不需要手术。首先要诊断出囊肿是良性还是恶性，如果确定是良性、囊肿又很小，直径在5公分以内，就可以先观察，不做治疗。如果确定囊肿是恶性的，就应及早手术治疗，同时还应配合放射治疗及抗癌药物治疗。但应该注意的是，有时候囊肿也可能出现良性特征、恶性增长的情况，肿瘤会长得很大、压迫到周围组织，且同时伴有进行性加重的痛经及性交痛、盆腔有触痛性结节，这时候也是需要手术切除的。
女性在怀孕以及哺乳期间，卵巢是不会排卵的，这样就减少了卵巢工作的活跃性，而且在这期间也不会有经血，少了经血倒流的“供给”，原有的病灶坏死、钙化或吸收，囊肿自然变小了，不一定需要药物和饮食调理，也会被抑制发展，从而达到治疗和控制的效果。
另一方面，人体自身的脂肪中本身含有激素，并且脂肪可以将雄激素转化为雌激素，雌激素能够抑制卵巢囊肿的发展，食疗的意图旨在控制高脂、油腻食物的摄取。
早期的卵巢囊肿会出现小腹不适、小腹疼痛、白带增多、白带异味、白带色黄、月经失常。当囊肿影响到激素生产时，可能出现例如阴道不规则出血或毛体增多等症状。而发展到中晚期时，患者会感到呼吸困难、腹痛腹胀、尿频尿痛等症状，如不及时治疗最终会导致恶变……
在众多不孕患者中，因卵巢囊肿导致排卵不畅的病例并不少见，其原因在于当卵巢肿瘤出现后极有可能发生生长过快或破裂扭转等症状，从而影响卵巢血运和引起坏死，继而出现卵巢功能障碍和不排卵，因此对于不孕患者来说，应及早发现和治疗，避免病情恶化导致癌变……[详情]
卫生问题：
包括个人卫生和伴侣卫生两方面，因为阴道炎、宫颈炎等妇科疾病，发生逆行感染时可能导致盆腔炎，造成卵巢炎性包块。
饮食问题：
要少吃高脂肪的食物，多吃高纤维食物，医学证明，合理的控制饮食能有效抑制肿瘤的恶性病变。
不做丁克一族：
未婚和未生育的女性患卵巢囊肿的几率要远远大于生育妇女，这是由于分娩和哺乳能减少卵巢肿瘤的发生率。
服用避孕药：
打乱排卵规律，虽然服用避孕药的妇女患卵巢囊肿几率要低于普通妇女，但专家提醒，这并不是最好的预防方式。
